个人简介
严健，博士（Ph.D.）
教授，博士生导师，第四届陕西省细胞生物学学会理事
通信地址：西北大学生命科学与医学学部 314室
西安市太白北路229号，邮编：710069
电子邮件：jian.yan@nwu.edu.cn
【教育及科研经历】
2018年-至今，西北大学医学院，教授，功能基因组学
2015年-2018年期间，在美国加州大学圣地亚哥分校任兵教授实验室从事博士后工作，主攻三维基因组学和表观遗传学研究
2014年在瑞典卡罗林斯卡医学院取得医学科学专业博士学位，从事关于结直肠癌转录调控的研究（中国教育部优秀自费留学生荣誉）
2010年在芬兰赫尔辛基大学取得生物技术专业硕士学位
2005年本科毕业于清华大学生物科学与技术系（现生命科学学院），获得理学学士学位
【主要国家级研究项目】
2021.1-2024.1 2，国家自然科学基金-面上项目，开发新方法研究内源逆转录病毒HERV-H在胚胎发育中调控染色质高级结构的分子机理（主持，在研）
2019.1-2022.1 2，国家自然科学基金-面上项目，主持，利用高通量系统生物学方法研究2型糖尿病遗传风险的分子机制（主持，在研）
【主要研究方向】
1. 解析长非编码RNA的功能
2. 系统分析遗传疾病的分子机理
【招聘信息】
1. 诚聘师资博士后，待遇优厚，同时实行成果奖励制度。有分子生物学、生物信息学、医学背景的博士毕业生优先。
2. 欢迎对基因组学、表观遗传学、转录调控有兴趣的本科、硕士毕业生报考加入本研究团队硕士、博士项目。优秀硕士毕业生可直接报名考核制，免笔试入学博士项目。
主要研究成果
J. Yan#, Y. Qiu, A. dos Santos, Y. Yin, Yang E. Li, N. Vinckier, N. Nariai, P. Benaglio, A. Raman, X. Li, S. Fan, J. Chiou, F. Chen, K.A. Frazer, K.J. Gaulton, M. Sander, J. Taipale#, B. Ren#, Systematic analysis of binding of transcription factors to noncoding variants, Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03211-0 (IF=42.778; 第一作者&通讯作者)
W. Yi*, J. Li*, X. Zhu*, X. Wang*, L. Fan, W. Sun, L. Liao, J. Zhang, X. Li, J. Ye, F. Chen, J. Taipale, K.M. Chan, L. Zhang#, J. Yan#, CRISPR-assisted detection of RNA-protein interactions in living cells, Nature Methods 17(7) (2020) 685-688. (IF=30.822; 通讯作者)
L. Fan*, T. Wang*, C. Hua*, W. Sun*, X. Li, L. Grunwald, J. Liu, N. Wu, X. Shao, Y. Yin, J. Yan#, X. Deng#, A compendium of DNA-binding specificities of transcription factors in Pseudomonas syringae, Nature Communications 11(1) (2020) 4947. (IF=12.121; 通讯作者)
X. Wang, M.J. Cairns, J. Yan#, Super-enhancers in transcriptional regulation and genome organization, Nucleic Acids Research 47(22) (2019) 11481-11496. (IF=11.501; 通讯作者)
W.W. Greenwald*, J. Chiou*, J. Yan*, Y. Qiu*, N. Dai*, A. Wang, N. Nariai, A. Aylward, J.Y. Han, N. Kadakia, N. Barrufet, M. Okino, F. Drees, N. Vinckier, L. Minichiello, D. Gorkin, J. Avruch, K. Frazer, M. Sander, B. Ren, K.J. Gaulton#, Pancreatic islet chromatin accessibility and conformation defines distal enhancer networks of type 2 diabetes risk. Nature Communications 10 (2019) 2078. (IF=12.121; 共同第一作者)
J. Yan, S.A. Chen, A. Local, T. Liu, Y. Qiu, K.M. Dorighi, S. Preissl, C.M. Rivera, C. Wang, Z. Ye, K. Ge, M. Hu, J. Wysocka, B. Ren#, Histone H3 lysine 4 monomethylation modulates long-range chromatin interactions at enhancers, Cell Research 28(2) (2018) 204-220. (IF=20.507；第一作者)
J. Yan, M. Enge, T. Whitington, K. Dave, J. Liu, I. Sur, B. Schmierer, A. Jolma, T. Kivioja, M. Taipale, J. Taipale#, Transcription factor binding in human cells occurs in dense clusters formed around cohesin anchor sites, Cell 154(4) (2013) 801-813. (IF=38.637；第一作者)
A. Jolma*, J. Yan*, T. Whitington, J. Toivonen, K.R. Nitta, P. Rastas, E. Morgunova, M. Enge, M. Taipale, G. Wei, K. Palin, J.M. Vaquerizas, R. Vincentelli, N.M. Luscombe, T.R. Hughes, P. Lemaire, E. Ukkonen, T. Kivioja, J. Taipale, DNA-binding specificities of human transcription factors, Cell 152(1-2) (2013) 327-339. (IF=38.637；共同第一作者)
I.K. Sur, O. Hallikas, A. Vaharautio, J. Yan, M. Turunen, M. Enge, M. Taipale, A. Karhu, L.A. Aaltonen, J. Taipale#, Mice lacking a Myc enhancer that includes human SNP rs6983267 are resistant to intestinal tumors, Science 338(6112) (2012) 1360-3.
Y. Yin, E. Morgunova, A. Jolma, E. Kaasinen, B. Sahu, S. Khund-Sayeed, P.K. Das, T. Kivioja, K. Dave, F. Zhong, K.R. Nitta, M. Taipale, A. Popov, P.A. Ginno, S. Domcke, J. Yan, D. Schubeler, C. Vinson, J. Taipale, Impact of cytosine methylation on DNA binding specificities of human transcription factors, Science 356(6337) (2017).
